Suomen ortodoksinen kirkko on julkisoikeudellinen toimija, jonka hallintoa ohjaavat monet yhteiskunnalliset säädökset.
Näistä keskeisimpiä ovat Laki Suomen ortodoksisesta kirkosta ja Kirkkojärjestys. Kirkon kanoninen asema on määritelty vuonna 2023 annetussa tomoksessa.
Kirkon on lisäksi noudatettava toiminnassaan myös yleisiä hallinto-oikeudellisia periaatteita ja lakeja, joista voidaan mainita mm. hallintolaki, hallintolainkäyttölaki, henkilötietolaki, laki viranomaisen toiminnan julkisuudesta, laki sähköisestä asioinnista, laki säädettyjen määräaikain laskemisesta ja kielilaki .
Kirkon työehtosopimus on voimassa 31.1.2028 asti.
Kirkon toimintaa ohjaavat myös kirkon itselleen määrittelemät ohjeet ja linjaukset. Näitä ovat mm. kirkon kulttuuriperintöstrategia ja ympäristöohjeisto .