Suomen ortodoksisen kirkkomuseon ja Kirkollishallituksen pääsisäänkäynnistä pääsee rakennuksen ensimmäisessä kerroksessa sijaitsevaan Kuopion ja Karjalan metropoliitan kotikirkkoon. Se on pyhitetty pyhän apostoli ja evankelista Johannes Teologin ja Karjalan valistajien kunniaksi. Kahden temppelijuhlan lisäksi pyhäkössä toimitetaan säännöllisiä klo 8.00 alkavia liturgiapalveluksia joka keskiviikko suuren paaston alkamiseen saakka ja sitten Pääsiäisestä aina toukokuun loppuun. Seuraava liturgia on 9. tammikuuta johon kaikki ovat lämpimästi tervetulleita. Palveluksen jälkeen tarjotaan Kirkollishallituksen ruokasalissa kirkkokahvit.